此後薩拉丁將阿尤布王朝的勢力擴張至葉門、敘利亞和伊拉克等地，並多次擊退十字軍，成為西亞北非地區強國。但誰也不會想到，如此一個強大的阿尤布王朝，卻在未及一代即開始分裂，除了其主支繼續統治埃及外，其他領地，如葉門、大馬士革、梅雅法裡金等地域先後脫離阿尤布王朝，另立政府。

在薩拉丁死後，阿尤布王朝一度由薩拉丁其子弟瓜分，阿尤布王朝迅速陷於分裂狀況，但不久被薩拉丁的義弟阿迪勒一世重新統一。

阿迪勒一世雖然一度重新統一大部分領地，但只持續了很短時間，便再度陷入分裂。這隻能怪薩拉丁的子孫一代不如一代。薩拉丁如此的一個英雄人物，可是他的子孫卻沒有一個像樣的。到十三世紀初葉阿尤布王朝徹底成為阿巴斯帝國（黑衣大食）的附庸國。

1248年法國卡佩王朝第九任國王路易九世傾全國之力發動第七次十字軍東征出擊，據說這次的東征大軍有14萬人，軍艦1800多艘，目標是薩拉丁後人蘇丹薩利赫統治下的埃及。薩利赫聽到法國人要攻打自己的訊息後，嚇得不知所措，也許薩拉丁的靈魂在天國保佑這個不爭氣的後代，就十字軍在佔領了達米埃塔港之後，一場瘟疫突然襲擊，使得十字軍元氣大傷。

十字軍恢復元氣後，繼續向開羅發動進攻，也許是因為驚嚇過度，蘇丹薩利赫突然暴卒。路易九世十字軍形勢似乎大好，但由奴隸組成的馬穆魯克近衛軍在薩利赫的愛妾“珍珠小枝”的率領下仍然打敗了十字軍。路易九世御弟阿圖瓦伯爵捐軀，路易九世本人也“光榮地”淪為階下囚，在法國人交納了80萬金幣的贖金後才被獲釋。

表面看上去這場戰役，阿尤布王朝是獲勝者，但實質卻是徹底的失敗者。突厥籍馬穆魯克人在“珍珠小枝”的帶領下打敗了十字軍，但是卻順勢滅亡了阿尤布王朝。馬穆魯克將領阿依巴克看中“珍珠小枝”的美貌，跟她勾搭連環，不但殺掉了年幼的繼承人，兩人還結為夫妻。自此後，阿依巴克將阿尤布王朝推翻，取而代之是馬穆魯克政權。自此“馬穆魯克奴隸王朝”誕生。

馬穆魯克在阿拉伯語系中是“奴隸”的意思。從公元九世紀起，阿巴斯帝國的哈里發們開始從小亞細亞和高加索地區購買奴隸，經過嚴格訓練以後，組建成騎兵部隊，由哈里發直接指揮，用以抗衡擁兵自重的阿拉伯各部落首領。

後來阿拉伯各地的蘇丹紛紛效仿，不惜花大價錢購買馬穆魯克，將其組建成自己的騎兵部隊。馬穆魯克士兵雖然是奴隸身份，但由於其作戰勇敢，而且不懼生死，深得主人的器重，待遇優厚，收入頗豐，馬穆魯克將領往往能夠進入政壇高層擔任職務。

阿巴斯帝國（黑衣大食）的巴格達哈里發拒絕承認這阿依巴克竊國大盜，同阿依巴克馬穆魯克政權發生多次武裝衝突。但並有佔到任何便宜，因為馬穆魯克人實在是太難對付，他們強大的戰鬥力在當時幾乎於無敵狀態。

西元1258年，一支來自東方的大軍來到伊斯蘭世界中，那就是蒙古西征軍。蒙古人來了，任誰也無法阻止他們的彎刀和戰馬，很快蒙古人攻滅了阿巴斯帝國，巴格達慘遭屠城厄運，使得開羅成為伊斯蘭世界的中心。而埃及馬穆魯克王朝從此登堂入室，成為伊斯蘭世界的頂樑柱，也成了唯一可配跟蒙古人交手的軍隊。