在回答這個問題之前，我們可以回望歷史。
在《史記 秦始皇本紀》中記載：
秦始皇帝者，秦莊襄王子也。莊襄王為秦質子於趙，見呂不韋姬，悅而取之，生始皇。以秦昭王四十八年正月生於邯鄲。
在《史記 呂不韋列傳》中記載：
呂不韋取邯鄲諸姬絕好善舞者與居，知有身。子楚從不韋飲，見而說之，因起為壽，請之。呂不韋怒，念業已破家為子楚，欲以釣奇，乃遂獻其姬。姬自匿有身，至大期時，生子政。子楚遂立姬為夫人。
後世編造的秦始皇的生父是呂不韋，主要出自《史記 呂不韋列傳》，因為這裡加了一個呂不韋貢獻姬妾的前提，那就是趙姬身懷六甲。
這是司馬遷不嚴謹嗎？胡編亂造寫下的記載嗎？恰恰相反，這是司馬遷嚴謹的史學態度。當他面對歷史事實的不同說法，而沒有發現其他戰國時期史料的記載，司馬遷沒有選擇將保留一種說法給以記載，而是選擇將兩種記載都編寫下來，其目的是讓後世的修史者參考和判斷。
但是在自己的記敘中，司馬遷也有自己的態度，他在《秦始皇本紀》中明確一點，秦始皇是秦莊襄王的兒子，秦始皇作為《秦始皇本紀》的傳主，司馬遷在記敘時自然要明確傳主的身份，所以司馬遷編撰《秦始皇本紀》的第一句話就是：秦始皇帝者，秦莊襄王子也。這說明司馬遷並不認同秦始皇的生父是呂不韋，而呂不韋貢獻懷孕姬妾的故事司馬遷將其放在《呂不韋列傳》，這是呂不韋的一個重要傳說，於是予以記載。其實《史記》記載的很多玄幻故事大多都在列傳之中，類似於奇聞異事。
《史記 呂不韋列傳》的記載被後世很多史學家沿用，司馬光就在《資治通鑑》沿用，但是這種狸貓換太子的獵奇故事始終吸引著市井大眾，明朝時期的演義小說《東周列國志》更是把呂不韋獻上懷孕的趙姬的傳說描寫的更為細緻，畢竟符合明朝市民的獵奇追求。更不用說近些年的玄幻歷史劇。
1986年香港的《秦始皇》一劇便說趙國商人呂不韋獻上懷孕的趙姬給秦莊襄王、張豐毅版《秦始皇》、陳凱歌的《荊軻刺秦王》都是講述呂不韋是秦始皇的父親，要知道這些歷史影視劇為了收視率，很容易搞這些狗血噱頭以獵奇的心態吸引觀眾，再加上影視劇傳播的受眾面十分廣，很多人在沒有閱讀史學的基礎下很容易就被影響，加之這些年來眾多自媒體搞出的地攤歷史學大肆傳播，所以呂不韋作為秦始皇生父的說法受到了很大傳播，得到了很多人的認可。
但是我這裡要吐槽一下，我們在現實生活裡都能看到不少已婚男性為了驗證孩子是不是自己所生，瘋狂做DNA驗證要死要活的案例，在兩千多年前的秦國，作為一國之君也是男性的秦莊襄王為什麼對於秦始皇沒有身份懷疑？秦莊襄王周圍的秦國宗室、母系外戚為什麼對於秦始皇沒有身份懷疑？說秦始皇是呂不韋的兒子，這不僅是對於秦莊襄王智商的侮辱，也是對於秦莊襄王男性自尊的踐踏。他在看到自己的兒子不像自己的時候，都不知道分析一下是不是自己的兒子。
試問一個“智商有問題”的秦莊襄王，呂不韋作為投資人為何要投資？那麼只能說明呂不韋也不是一個正常人，兩個不正常的人居然在逆境中奪取了秦國的大權，秦國的朝廷真的好糊弄，被兩個傻子糊弄了，可見秦國的君臣都是“傻子”，這樣的“傻子”君臣居然在戰國時期為第一強國，那麼東方六國究竟是有多無能呢？那麼究竟誰是傻子，是誰有心出於那些目的欺騙大家？
《戰國策》成書於《史記》之前，是由西漢劉向編訂，裡面並沒有對於秦始皇身世的懷疑，也沒有關於呂不韋獻上懷孕姬妾的記載，反而是楚幽王的身世記載十分有意思。
《戰國策》中的這一篇文章名為《楚考烈王無子》，擷取其中的記載如下：
楚考烈王無子，春申君患之，求婦人宜子者進之，甚眾，卒無子。趙人李園，持其女弟，欲進之楚王，聞其不宜子，恐又無寵。李園求事春申君為舍人。已而謁歸，故失期。還謁，春申君問狀……。。於是園乃進其女弟，即幸於春申君。知其有身，園乃與其女弟謀……。。春申君大然之。乃出園女弟謹舍，而言之楚王。楚王召入，幸之。遂生子男，立為太子，以李園女弟立為王后。楚王貴李園，李園用事……。。李園既入其女弟為王后，子為太子，恐春申君語洩而益驕，陰養死士，欲死春申君以滅口，而國人頗有知之者。春申君相楚二十五年，考烈王病……。。。。。後十七日，楚考烈王崩，李園果先入，置死士，止於棘門之內。春申君後入，止棘門。園死士夾刺春申君，斬其頭，投之棘門外。於是使吏盡滅春申君之家。而李園女弟，初幸春申君有身，而入之王新生子者，遂立為楚幽王也。
聰明的讀者一看到這個故事，立刻就有了覺悟，我們如果把其中的主人公春申君、楚考烈王、楚幽王換成呂不韋、秦莊襄王、秦始皇，幾乎可以說是一模一樣，相差無幾。
我們可以看春申君和呂不韋究竟有多麼相似。
如此相似命運的兩個權臣，如此相同的兩個故事，楚幽王是春申君之子，秦始皇是文信侯之子，如此相同的流言，事情的真相到底是是什麼？
楚國的故事與秦國不同。楚幽王繼位後統治了楚國十年，在此期間，李園作為外戚執掌朝政。楚幽王去世後，李園之妹所生的第二子，即楚幽王的同母弟熊猶登基為王，是為楚哀王，楚哀王登基兩個月多，楚考烈王之子熊負芻發動政變，擁戴熊負芻發的政治勢力指揮自己的附屬兵馬殺死了楚哀王和李園，熊負芻登基為王，即最後一代楚王負芻。
楚王負芻作為庶子稱王，擁戴熊負芻發的政治勢力當權，他們勢必要為自己的政變尋找合法性，主要是解釋熊負芻為什麼要殘忍殺死自己的弟弟，公然推翻楚哀王政權。如果熊負芻的嫡母所生的兩個兒子熊猶和熊悍都是春申君的兒子，血統都不是楚國公室的血脈，那麼故事就完全不一樣了。
在楚國公室血脈受到侮辱、楚國王室的統治受到外戚李園威脅的時候，庶子熊負芻和楚國的大臣們忍辱負重十年，等待著復興楚國的機會、以及澄清公室穢亂的狀況。最後熊負芻找到機會，在偽王熊猶登基未穩的時候挺身而出，殺死作惡多端的權臣李園，剷除了威脅楚國統治的李氏外戚，以及殺死在王座上的偽王熊猶，真可謂是“掃清玉宇、平定天下”。
而且這個故事的巧妙之處在於熊負芻置身於事外，在李園獻妹的故事裡，李園和妹妹憑藉自己的計謀，最終獲得了楚國的大權，是最終的勝利者，但是李園和妹妹的形象是典型的小人得志。而且穢亂宮廷的事件，出於人性，無論男女都會十分厭惡，出於政治鬥爭，顯得十分下作。凡是閱讀過這個故事的人對於李園此人十分討厭，當李園被殺的那一刻，所有人都覺得幹得漂亮。所以李園兄妹在熊負芻塑造的政治故事變成了真正的受害者，死人春申君不能說話，變成了一個“傻子”，一個楚考烈王身邊的陰謀家，至於楚考烈王在自己兒子的故事也變成一個“傻子”。
回到呂不韋，在呂不韋獻趙姬的故事裡，明顯含有對於秦始皇的血統懷疑，這種懷疑便是對秦始皇統治的合法性攻擊。在這個故事裡，秦莊襄王、呂不韋、趙姬都是受害者，最大的受害者便是秦始皇。自三代以來、延續千年的血統貴族秦國公室居然被秦始皇鳩佔鵲巢，這無疑是豎起一面政治旗幟攻擊秦始皇。
只是秦始皇不是楚幽王，也不是楚哀王，他的果決勇毅使得他的統治十分穩固，但是他駕崩之後的事情，他就不可能控制了。
秦始皇的政敵太多了，無論是他的生前還是死後。
在他生前，秦國國內的政敵就有呂不韋、嫪毐、母親趙姬、弟弟成蛟、楚系外戚，在秦國國外有六國的舊貴族、仇視秦朝的遊俠、懷念舊國的民眾、“聚義”的大盜、反對秦朝計程車人，在他統治的時候，這些人有的被消滅，有的人流落江湖，有的人暗中積蓄力量。最終在他死後，由於胡亥的胡作非為，天下大亂，無數人開始攻擊秦始皇。
不過在漢初的時間裡，秦始皇並未受到主要攻擊，漢高祖劉邦曾經設二十家為秦始皇守陵，漢文帝時期的賈誼寫過《過秦論》，這篇政論分為三篇，我讀高中時學習的是上篇，實際上還有中篇和下篇，賈誼重點攻擊亡國之君秦二世，對於秦始皇的攻擊並不太深，這也是漢初學者的看法，也是當時漢朝思想界的看法。
但是儒家豎起旗幟反對他，暴君，桀紂幾乎是他的代名詞、在漢朝前期還有所保留，在漢武帝之後幾乎就是各種攻擊，秦始皇成為暴君的代名詞，此後為了現實政治服務，秦始皇成為政治文化符號，無數人抨擊他的暴政以此勸諫當朝的君主，於是秦始皇的罪行被進一步擴大化，從此延續兩千年。
在這種超長時間的政治攻擊下，商人呂不韋之子的秦始皇更加符合統治階級的看法，畢竟“高貴的血脈”是不可能出現暴君的，只有士農工商最低一等的“商人血脈”才會出現這樣的人。到了現代，各種玄幻狗血層出不窮，這麼好的題材，又是被大肆喧囂，至於真相也許很多人就不在乎。