《寵物小精靈》裡的道館館主是道館內的最強訓練家，他們各自精通一種特定屬性，在道館內負責與挑戰者進行對戰，如果挑戰者透過考核便可以獲得相應的徽章。

神奇寶貝世界裡的每個地區都會設立數量不同的道館，而每位館主都是經過神奇寶貝聯盟精心挑選出來的精英，但家族繼承這種也不是沒有，因此許多年輕的道館館主都不會遵從前任館主的意願坐鎮道館，他們懷揣著自己的理想離開道館展開旅程，這其中當然也包括小智身邊的幾位館主。

石英聯盟

尼比道館館主“小剛”

在所有道館館主中，小剛是最痴迷於漂亮妹子的館主，而且他不僅是館主，同時也是尼比博物館的守護者，起初與小智對戰時因為小智和皮卡丘太過散漫鬆懈不認真，因特別生氣想要用大巖蛇好好教育他們，可誰知最後大巖蛇卻敗給皮卡丘，後來還是將徽章親手交給了小智，最後決定與小智一起旅行。

華藍道館館主“小霞”

起初小霞只是一位普通的訓練家，因為小時候的心理陰影而懼怕暴鯉龍，所以在她之前都是由她的三位姐姐坐鎮道館的，但是後來在一次意外中小霞克服了對暴鯉龍的恐懼感並獲得了暴鯉龍的信任，與小智的旅行告一段落後，小霞透過道館館主的試煉成功當上華藍道館館主。

合眾聯盟

三曜道館館主“天桐”

因為三曜道館中的館主是由天桐與兩位兄弟一起坐鎮，所以天桐只是其中一位館主，同時他也是一位神奇寶貝酒侍，因為在小智得到館挑戰中輸給小智，所以決定與其一同旅行增長見聞。

雙龍道館前任館主“艾莉絲”

艾莉絲曾是雙龍道館館主之一，後來成為合眾聯盟“冠軍”，但在此之前都是與小智一同旅行的夥伴，因為總是以長者的口吻說小智，所以兩人總是會鬧些小別扭，但關鍵時刻還是很可靠的。

卡洛斯聯盟

密阿雷道館館主“希特隆”

希特隆的本質是道館館主，但他卻有著一顆發明家的新，而且與小智一同旅行的時候總是會製作一些半吊子的發明，之所以說他半吊子，主要是因為它的發明大多數都會在使用時對使用者造成傷害，例如自爆這種就是市場發生的事情。