【乾貨講座】生物資訊學家教你如何使用奈米孔資料對基因組甲基化進行檢測和定相

摘要:Oxford Nanopore應用小組的一名生物資訊學家Philipp Rescheneder介紹如何使用奈米孔資料對基因組甲基化進行檢測和定相。

【乾貨講座】生物資訊學家教你如何使用奈米孔資料對基因組甲基化進行檢測和定相

表觀遺傳學是有關化學修飾的研究,這是一個正在蓬勃發展的研究領域,研究人類表觀遺傳修飾(包括對 DNA、RNA 和組蛋白的修飾)對於很多領域具有重要意義。然而,傳統檢測表觀遺傳學的技術存在一些侷限性。例如,短讀長測序技術包含聚合酶鏈式反應 (PCR),在這期間會丟失表觀遺傳修飾。由於其不能對甲基化直接測序,因此在測序前需要對 DNA 樣本進行化學處理,以此推斷甲基化的存在。

奈米孔測序可在無需 PCR 的情況下,製備和測序天然 DNA 和 RNA 分子。這樣就可以在檢測核苷酸序列的同時直接檢測完整甲基化,無需任何化學轉化或額外的文庫製備步驟。端到端的奈米孔工作流程具備簡單的文庫製備流程,結合靈活的測序選項,可滿足各類實驗目標,針對靶向區域或人類全基因組提供了前所未有的甲基化解決方案。

11。23日,來自Oxford Nanopore 應用團隊的生物資訊學家Philip將為大家介紹如何使用奈米孔資料對基因組甲基化進行檢測和定相,主要內容有:

甲基化定義及其重要性

如何進行甲基化分析,需要什麼樣的資料,讀長建議

利用奈米孔測序技術進行甲基化檢測的結果與分析

演講嘉賓

【乾貨講座】生物資訊學家教你如何使用奈米孔資料對基因組甲基化進行檢測和定相

Philipp Rescheneder

Oxford Nanopore應用小組的一名生物資訊學家。目前,他主要負責鑑定、評估和除錯最合適的相關工具和工作流程,用於分析不同應用領域的奈米孔測序資料,包括變異識別、組裝和識別甲基化。在加入Oxford Nanopore之前,他的研究重點是開發計算工具,以有效地比對長/短讀長測序的噪音。

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