奧美拉唑和艾司奧美拉唑都是質子泵抑制劑，自問世以來被臨床廣泛使用，其抑制胃酸效果明確，臨床常用於因胃酸分泌過多造成的各種消化道疾病，如胃腸潰瘍、慢性胃炎、反流性食管炎、卓艾綜合徵等。

艾司奧美拉唑也叫做埃索美拉唑，是質子泵抑制劑中的第二代，奧美拉唑是第一代。艾司奧美拉唑是奧美拉唑的左旋異構體，去掉了奧美拉唑的右旋結構，其副作用會相應較少，但是起效的主要是左旋體，所以其作用效果不會減弱，這就是它們倆的主要區別。

不管是使用奧美拉唑還是艾司奧美拉唑，都需要注意其副作用，特別是長期使用的患者。研究發現長期使用質子泵抑制劑胃泌素增多，可能引起肝癌、胃癌風險增高；

另外增加骨質疏鬆風險，因為胃酸被抑制，會導致機體對鈣的吸收，干擾骨的代謝。

其次胃腸道菌群受到影響，雙歧桿菌、乳酸桿菌數量會明顯下降，腸道生物屏障受損，增加腸源性感染風險，比如艱難梭菌感染。

還有胃內PH上升，胃內細菌繁殖增加，反流到喉部，以及肺內腺體表面H+/k+-ATP酶被抑制，增加肺部感染風險。也有一些使用質子泵抑制劑引起間質性腎炎的報道，這可能與奧美拉唑等代謝物影響腎臟排洩功能。

總之艾司奧美拉唑服用劑量更低，副作用發生率更小一些，但是其價格也更貴，選擇的時候需要多方面考慮。