目前，醫療大資料的應用仍然處於初級起步階段，面臨很多問題和挑戰，主要包括：（1）機制和標準不完善，國家關於大資料已經出臺了很多指導性意見，但是涉及到具體的建設標準和技術規範還需要進一步細化完善，此外由於資訊化建設過程中廠家各異，標準規範也各不相同；

（2）關鍵技術需要突破，一是大資料的整合技術，尤其是針對醫療行業中的大量非結構化資料，二是大資料的儲存技術，主要是分散式儲存架構的建設，三是大資料的分析技術，對文字、影象等醫療資料的分析方法和能力需要創新；

（3）資料的整體質量不高，由於我國的資訊化建設的逐步進行的，在實際的建設過程中，基礎資料缺失、資料錯誤等問題廣泛存在，利用大資料技術採集彙總後的整體資料質量不高；

（4）資料安全和隱私有待加強，醫療資料具有很強的隱私屬性，是一類比較特殊的資料，如何從管理和技術層面保障大資料的安全隱私是現實面臨的問題之一；

（5）複合型人才的缺失，醫療大資料的建設和應用，不僅僅需要計算機與資訊領域的專業人才，還需要對衛生管理、臨床醫療、統計分析等方面有。

大資料技術在醫療衛生行業的應用日益廣泛，本文在分析醫療大資料特徵的基礎上，構建了醫療大資料應用體系架構，從資料的採集、儲存、分析、交換共享和應用五個層次詳細闡述了大資料技術在醫療衛生行業應用的體系架構。

醫療大資料透過在政府部門、醫療機構、社會公眾和行業企業等方面的應用可以發揮醫療大資料的巨大價值。大資料技術提高了醫療衛生行業資料利用，為醫療衛生行業的發展帶來了新的方向，具有重要的研究意義。