根據苦瓜的需肥規律和安全高效生產要點，苦瓜在施肥方面應採取底肥為主，追肥為輔的科學施肥方法。在施足有機肥的情況下，補充適量的化學肥料。化學肥料可選用龍飛大三元複合肥，或按氮、磷、鉀以3：1：4的比例進行配比施用。氮肥以尿素為主，磷肥可選用過磷酸鈣或用磷酸二銨代替，鉀肥可選用硫酸鉀。施肥量可根據土壤供肥情況和目標產量進行確定，按總施肥量的70%作底肥、30%作追肥進行施用。
基肥：
苦瓜的基肥，是指在苦瓜播種或定植前施用的肥料。它不但能供給苦瓜植株整個生長期所需要的養分，為苦瓜生長髮育創造良好的營養條件，而且還具有改良土壤、培肥地力的作用。作基肥施用的肥料大多是遲效性的肥料。如有機肥料的既肥、堆肥、家畜糞等是最常用的基肥。化學肥料的全效緩（控）釋肥或磷肥和鉀肥，一般也作基肥施用。常用基肥施用方法有：
（1）普遍撒施就是將肥料均勻地撒於地面，然後用犁耙耕作，把肥料翻入土壤裡面，使肥料與土壤充分混合均勻。其特點是方法簡單易行，根系吸肥面積大，但需要施肥量大。
（2）溝施是在耕翻整地後，在田間放線開溝，然後把肥料均勻地撒入溝內，上面覆土，以備播種或栽苗。其特點是節省肥料，有利於提高肥效，但根系吸肥面積小。
（3）穴施田間翻耕整平後，按行距放線，按株距挖穴，把肥料施入穴裡並覆土，供栽苗備用。該法既節約肥料，又能提高肥效，但較費工。
追肥：
（1）土壤追肥追肥應按照前期輕、中期重、後期補的原則進行，一般於開花坐果後進行第一次追肥，用肥品種和數量為：龍飛大三元有機無機生物肥50千克/田，或尿素15~20千克+硫酸鉀10~15千克/畝。以後每採收一次瓜，每畝再追施尿素15千克。每採收2次瓜追施龍飛大三元有機無機生物肥50千克/畝。以防止植株早衰而影響果實生長。
（2）苦瓜葉面追肥在苦瓜生長期間，以無機肥料、微量元素或生長激素等的稀薄溶液，結合人工降雨或用噴霧器將低濃度肥料水溶液噴灑到植株上，藉著水分的移動，從葉和枝梢的氣孔進入植株體內部的施肥方法，稱為葉面追肥，又稱葉面施肥、根外追肥。
苦瓜噴施葉面肥的作用葉面噴施肥料可以在其他施肥方式不允許的情況下和一些特定的情況下，及時為植物補充所需的養分，以滿足其生長髮育的需要。葉面噴肥對苦瓜有明顯的增產效果，特別是苦瓜結果盛期、遇病蟲侵襲時、出現缺肥症狀時，噴施葉面肥，能及時補充苦瓜結果期所需要的營養物質，有利於苦瓜幼果的良好發育，多結瓜，結大瓜，減少畸形果，從而提高苦瓜的產量和商品率。
有關資料表明，在中等肥力土壤上，苦瓜採用葉面追肥2~3次，可增產5%~20%。苦瓜葉面追肥的特點它的突出優點是針對性強、吸收速度快（噴施後5小時即開始吸收，能延續7~10天），不受土壤環境因素影響，可以避免養分被土壤固定，養分利用率高，且施肥量少，施用方法簡單，增產效果顯著，尤其在受病蟲危害、土壤環境不良、水分過多或乾旱、土壤過酸或過鹼造成根系吸收作用受阻或植株急需營養以及苦瓜生長後期根系活力衰退時，採用葉面追肥可以彌補根系吸肥的不足，對增加苦瓜的產量和質量有著積極的作用。
常用的葉面追施肥：
料種類葉面追肥的常用肥料品種、用法及用量為：細糠、麥麩5~6千克，加水50千克，浸泡2晝夜過濾後莖葉噴霧。尿素150~250克，加水50千克溶解後莖葉噴霧。過磷酸鈣2~2。5千克，加水50千克，浸泡2晝夜過濾後莖葉噴霧。氧化鉀250~500克，加水50千克溶解後莖葉噴霧。草木灰1。5-2。5千克，加水50千克，浸泡2晝夜過濾後莖葉噴霧。不能與氮肥同時應用。
特別提示：
葉面施肥可結合打藥進行。如果噴施後24小時內遇雨，應補噴籮葉面肥種類的選擇要有針對性。苦瓜主要是從土壤中吸收營養元素，土壤中營養元素的含量對苦瓜的生長起著決定性作用。葉面肥只是起到一定的補充調節作用，適合作葉面追施的肥料通常稱作葉肥、葉面肥或葉面營養液。葉面肥按成分可以分為氮肥、磷肥、鉀肥、磷鉀複合肥、氮磷鉀複合肥、微肥、稀土微肥腐殖酸液肥以及加入植物生長調節劑的葉面肥料等。
生產上常用的葉面肥品種有尿素、磷酸二氫鉀、硫酸鉀、過磷酸鈣、硼砂鉬酸銨、硫酸鋅、稀土微肥、光合微肥、噴施寶、草木灰浸出液以及米醋、蔗糖等，這些肥料具有效能穩定，不損傷葉片等特點。葉面追肥應以氮、磷、鉀混合液或多元複合肥為主。因此在確定葉面肥種類前最好先測定土壤中各元素的含量及土壤酸鹼度，缺什麼補什麼，以達到充分發揮肥效的作用。有條件的也可以測定苦瓜植株中營養元素的含量，或根據缺素情況確定葉面肥的種類及用量。
在植株出現缺肥的情況下，可以選用氮、磷、鉀為主的葉面肥；在植株長勢正常的結果盛期，可以選用以微量元素為主的葉面肥。如苦瓜出現“裂瓜”、“花而不實”、“落花落果”現象，是缺硼所引起的，可以噴施硼砂或硼酸。按照“對症下藥”的原則，把苦瓜所缺乏的某種營養，配成適宜濃度的溶液，進行葉面噴灑，效果較好。此外，也可選用複合微肥，如氨基酸鈣液肥、活力素、植物動力2003活力鈣、施得樂、螯合態多元複合肥、多元素綜合微肥等，補充鉀、鈣、鋅、硼等元素，增產效果更好。
嚴格掌握噴灑濃度，葉面噴灑濃度要適宜，濃度過低，達不到追肥的目的；過高易發生肥害或毒素症。由於葉面追肥是直接噴施於苦瓜葉片表面，不能像土壤施肥那樣利用土壤的緩衝作用來緩解高濃度肥料帶來的危害，因此葉面追肥應掌握好施用濃度。濃度過高不僅會增加成本，還會灼傷葉片，造成肥害，引起不必要的損失，特別是微量元素肥料，從缺乏到過量之間的臨界範圍很窄，更要嚴格控制；濃度過低，苦瓜接觸的營養元素量小施肥效果不明顯。施用時期和時間要科學。
全生育期均可施用，但應避開盛花期，一般在晴天的早、晚或陰天進行，噴後3小時內下雨，天晴後應補噴，但濃度要降低。肥料混合要合理。如將兩種以上葉麵肥混用，其增產效果極為顯著。但不能任意混用，如磷酸二氫鉀不能與稀土混施；人尿、沼液不能與草木灰浸出液混用。另外，進行葉面追肥時儘量不與鹼性農藥混用。肥料與農藥混合要合理。
葉面肥可以和大部分防治病蟲的藥劑混合使用，為了減少人工勞動強度，噴灑葉面肥可以和大部分的藥劑混合使用，起到事半功倍的效果。但鹼性藥劑除外。葉面追肥不能代替土壤施肥。葉面追肥只能是一種補充，必須在施足基肥並及時追肥的基礎上，才能取得理想效果，切忌依靠葉面追肥獲得高產的做法。在實際施肥時，因有機肥施用量大，為節省人工可採取撒施的方法。化學肥料可採取集中施肥，根據具體情況選用溝施或穴施的方法。這樣可經濟有效地發揮有機肥和化學肥料的互補作用，使苦瓜獲得高產。在遇到病蟲侵害或出現缺肥症狀時，施用葉面肥。